1月，高雄長庚醫院開幕，院方聘請吳敬次主任返國負責籌備成立放射腫瘤科事宜。 8月，物理師吳嘉明、薛文隆至林口院區代訓
年初，吳敬次主任返美，由林口院區林芳仁主任繼續籌備成立事宜。門診由林芳仁主任負責，住院醫師馬玉麟、洪志宏、趙坤山、王重榮每月輪調協助。 年底，第一部直線加速器(NEC 1018D, 10MV)及模擬攝影機(NEC)裝置完成。
7月，洪志宏醫師調任高雄院區專職主治醫師一年。政府開辦農保。
6月，王重榮醫師調任高雄院區專職主治醫師。 12月，鈷六十遠隔治療機遷移高雄院區使用。
4月，梁雲醫師接任科主任，高雄院區放射腫瘤科營運、財務、維修正式獨立。 5月，第二直線加速器(Simens KDS, 10MV)安裝啟用。 7月，陳惠君醫師晉升主治醫師，全科三位主治醫師。
1月，第一套2.5D電腦治療計劃系統(Theraplan)及後荷近接治療機(Nucletron, Plato) 啟用。 7月，高醫黃志仁醫師至本科受訓一年。
1月，完成科內癌登電腦化。 3月，Stereotactic radiosurgery (Brain Lab) 啟用。 6月，發行衛教手冊第一版。 7月，全院門診醫囑電腦化。 方富民醫師、孫立民醫師晉升主治醫師。 擴建開挖第四、第五治療室。年底，安裝兩部Varian 2100C (6MV, 15MV + MLC及10MV + asymmetric jaw)直線加速器。
2月，Dr. Million (The University of Florida)至本科駐診教學1個月。 3月，政府開辦全民健保。 7月，鈷六十遠隔治療機拆除，移交核研所。
1月，建置本科網頁。 2月，購置ADAC電腦治療計劃系統，開始3D順形放射治療。5月，熱治療機(Hyperthermia, BSD)啟用。 7月，許軒之醫師、葉世安醫師晉升主治醫師。 王重榮醫師發表本科第一篇SCI論文於國際放射治療頂尖雜誌 International Journal of Radiation Oncology, Biology, Physics
1月，第五直線加速器(Varian 600C, 6MV)安裝啟用。 推動 Hepatoma radiotherapy。 6月，網路記錄驗證系統 (Varian, VARiS) 啟用。 8月，Varian模擬攝影機(Ximatron)完成啟用。 購入Olympus鼻咽鏡，頭頸癌的檢查更為方便有效。
4月，孫立民醫師赴美(The University of Wisconsin)進修半年。 7月，electronic portal image (EPI) 啟用。 黃英彥醫師、熊敬業醫師晉升主治醫師。 10月，劑量組成立，劉明祥任組長。 11月，王重榮醫師接任科主任。
1月，非醫師人員積效評核制度化，成立科內相關委員會，每月定期召開科務會議。 7月，成立醫師次專科制。 11月，熊敬業醫師赴美(Memorial Sloan-Kettering Cancer Center，NY)進修一年。 先後成立頭頸癌、婦癌聯合門診。
1月，渡過Y2K危機，立法院通過醫事放射師法。 4月，第一部CT simulator (Picker 5000、AcQsim)啟用 購置CadPlan 電腦治療計劃系統。 7月，與泌尿科合作攝護腺癌High-dose-rate implant 陳惠君醫師赴美(Baylor Medical Center，Texas)進修半年。 9月，Dr. Carlos Perez 來訪。
1月，第六、第七治療室擴建完成 發行實習醫師、實習技術師手冊、衛教單張。 12月，整併報到櫃台及簡化門診動線 實施醫師排程配額制。
1月，嘉義長庚放射腫瘤科開幕 陸續成立乳癌、食道癌、肝癌聯合門診。 10月，前主任梁雲醫師離職 醫師次專科小幅調整，並推動各次專科治療共識。
5月，SARS流行，全院警戒。 7月，第六部直線加速器Varian 21X (6MV, 10MV)啟用 開始執行IMRT治療。 黃郁傑醫師、汪昶佑醫師晉升主治醫師 全院PACS系統啟用，X光檢查無片化。 11月，獲醫策會醫療品質優良獎。
7月，方富民醫師赴美(MD Anderson Cancer Center，Texas)進修一年 第一直線加速器(NEC 1018D)拆卸除役。
7月，方富民醫師接任科主任 通過科內論文發表規範 11月，第七直線加速器(Elekta, Precision, 10MV, 6 MV)安裝啟用 榮獲原能會「94年度醫療曝露品質作業輔導檢查」優等獎。
4月，第八直線加速器(Brain Lab, Novalis, 6 MV) 及iPlan 電腦治療計劃啟用，開始執行影像導引放射治療
2月，治療驗證片網路無片化。 11月，李財福醫儀專員獲選醫事人員最優論文獎勵：第三名。 12月，Ximatron simulator拆除，第二CT-simulator (GE) 安裝啟用。
癌登電腦、報告系統升級改版。 9月，李財福醫儀專員獲選醫事人員論文獎勵：第二名。 王友明醫師晉升主治醫師。
2月，高雄院區癌症中心成立，於醫學大樓7樓設立整合式癌症門診區。 4月，ADAC Pinnacle電腦治療計劃系統升級，停用CadPlan系統。 通過科內非醫師人員論文及研究積效獎勵辦法。 7月，黃英彥醫師擔任副主任。 8月，第九直線加速器(Elekta, Synergy, 10MV, 6 MV) 啟用，執行IGRT。 近接治療定位驗證片無片化。 建置新記錄驗證系統(Impac, Mosaiq)啟用。 10月，李財福醫儀專員獲選醫事人員最優秀論文獎勵：第三名，趙珮如物理師獲選醫事人員論文獎勵：佳作。 12月，阮國榮技術組長支援廈門長庚，為期半年。
3月，方富民醫師榮獲「財團法人癌症防治基金會」SCI論文獎（放射腫瘤類） 方富民醫師、黃英彥醫師榮獲「台灣放射腫瘤學會暨中華民國醫學物理學會聯合學術年會」優秀壁報論文（臨床組）：優勝 趙珮如物理師榮獲「台灣放射腫瘤學會暨中華民國醫學物理學會聯合學術年會」優秀壁報論文（物理組）：優勝。 4月，協助廈門設置RTO開始試營運。 5月，王友明醫師支援廈門3個月 黃英彥醫師榮獲「第十五屆台灣癌症聯合學術年會」壁報論文競賽（臨床組）：佳作。 6月，阮國榮技術組長晉升放射治療醫事放射副主任。 全科流程管理QCL全面推動 9月，趙珮如物理師獲選醫事人員最優秀論文獎勵：第二名，陳文凱放射師獲選醫事人員論文獎勵：佳作。
6月，汪昶佑醫師離職。 7月，方富民科醫師晉升學術組教授級主治醫師。 8月，李財福醫儀專員榮退。 9月，趙珮如物理師獲選醫事人員最優秀論文獎勵：第二名。 12月，黃俊杰醫師晉升主治醫師。阮國榮放射治療醫事放射副主任晉升放射治療技術主任。
2月，方富民醫師晉升教育部部定教授 3月，決策會決議高雄安裝質子治療系統 全科監視系統更新完成 5月，黃英彥醫師榮獲「第十七屆台灣癌症聯合學術年會」壁報論文競賽（基轉組）：佳作 6月，衛生局通過高雄設置質子治療系統 11月，科內圖書室建置完成 治療計畫系統Pinnacle 9.2版開始啟用 趙珮如物理師獲選醫事人員論文獎勵：佳作 榮獲TRM團隊發表競賽獲得第五名、海報獲得佳作 第十台直線加速器Varian（Rapid Arc）安裝完成開始治療病人 12月，衛生署通過高雄設置質子治療系統，榮獲QCC品管圈成果發表競賽：佳作 「2012國家生技醫療品質獎」標章及銀獎 榮獲原能會「101年度醫療院所輻射安全與醫療曝露品質保證作業」優等獎
2月，本科放射治療之服務，榮獲「國際品質管理系統標準:ISO 9001:2008 (CNS12681) 及國際醫療照護品質管理系統標準: ISO/IWA1 2005」認證 10月，黃英彥醫師接任科主任 10月，榮獲第26屆全國團結圈活動競賽(團結組)銅塔組獎
3月，和住友重工簽約質子治療系統。 7月，黃英彥醫師晉升學術組教授級主治醫師 7月，王友明醫師榮獲102年優良教師 11月，周上愉醫師晉升主治醫師 12月，質子中心動工
2月，執行第一個 PET-CT simulation 2月，黃英彥醫師晉升教育部部定教授。 5月，王友明醫師獲得第二十屆台灣癌症聯合學術年會優秀壁報論文競賽臨床組第二名 7月，王友明醫師前往美國史丹福大學進修一年 8月，電腦刀啟用記者會 8月，聘請徐椿壽教授擔任醫學物理顧問 9月，黃梅月護理師獲選醫事人員論文獎勵：佳作 10月，黃英彥醫師兼任癌症中心主任 11月，舉辦粒子放射治療研討會
1月，舉辦電腦刀國際研討會 4月，電腦刀專刊在長庚醫訊刊登 5月，周上愉醫師榮獲103年優良教師 12月，質子機上樑典禮 12月，獲得第十七屆醫療品質獎智慧醫院門急診服務標章
1月，開始品保無紙化 3月，聘請李財福教授擔任醫學物理研究顧問 4月，質子加速器安裝 4月，本科新網頁啟用2017
2018
2月，高強度輻射設施試運轉計劃核准 6月，G2 試車計劃核准 10月，CT、迴旋加速器及第一治療室取得衛生局許可函 10月，質子治療中心開幕剪綵
2019
3月，G2 原子能委員及衛生局會許可証 4月，MRI衛生局許可函 8月，光子全部移轉質子治療中心
2020
1月，G3 原子能委員會許可証 7月，王友明醫師接任部主任 8月，G3衛生局許可函
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