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B型肝炎的感染是人類健康的問題，全球有超過3億5千萬的人口感染B型肝炎，其中約75％居住於亞洲及太平洋地區。而這些帶原者若沒有適當的治療則會有發生肝硬化和肝癌，甚至死亡的危險性。慢性B型肝炎帶原者已導致全球每年約有一百萬的人民死亡。目前已知B型肝炎病毒量的增加是導致慢性B型肝炎帶原者疾病進展的最重要因素之ㄧ。因此慢性B型肝炎帶原者接受藥物治療來降低B型肝炎病毒量是可以延緩肝臟疾病的進展。目前台灣已核准6種治療慢性B型肝炎的藥物，分別是兩種針劑為傳統型干擾素(conventional
interferon)，長效型干擾素(pegylated
interferon)。和四種口服抗病毒藥物為干安能(lamivudine)，干適能(adefovir)，貝樂克(entecavir)和喜必福(telbivudine)。
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干擾素為第一種被發現能有效治療B、C型肝炎的藥物，具有抗病毒及調節免疫的能力。干擾素是藉由提高身體的免疫力來達到清除B型肝炎病毒的目的。在長效型干擾素的臨床試驗中顯示，24週和48週長效型干擾素治療e抗原陽性病人在治療結束後24週觀察，e抗原反轉率約30-40%。而48週長效型干擾素治療e抗原陰性病人在治療結束後24週觀察，其病毒抑制和肝功能正常的比例也約30-40%。其效果比同用藥時間的干安能相比為好。干擾素治療會產生一些副作用例如感冒般症狀；頭痛、噁心、嘔吐、白血球降低、血小板減少，也有些人可能產生憂鬱、煩躁等症狀。干擾素治療必須用注射方式治療比較不方便。要注意的是！大多數的肝臟代償不全，肝衰竭與肝硬化患者，器官移植接受者和化學治療接受者，不宜接受干擾素治療。好處是干擾素治療不會有抗藥性病毒出現，治療療程固定。一般建議長效型干擾素治療e抗原陽性病人的時間為24-48週，治療e抗原陰性病人的時間為48週。
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臨床證實口服抗病毒藥可直接作用於病毒，抑制病毒的增生。當病毒濃度降低時，會減少肝臟的發炎。接受抗病毒藥物治療可有效降低肝臟發炎，減緩並改善肝臟纖維化至肝硬化速度。這些口服抗病毒藥物副作用少，服用方便。在降病毒和肝功能的效果不管使用一年或多年，目前以較新的2種藥貝樂克和喜必福效果最好。然而e抗原反轉率四種口服抗病毒藥物則差不多。長期口服抗B型肝炎病毒藥物可以減緩B型肝炎嚴重肝疾病的進展和防止肝衰竭的發生。然而長期口服抗B型肝炎病毒藥物治療的好處會因發生抗藥性病毒而限制。而發生抗藥性病毒後也可導致病人肝衰竭或死亡。因此治療期間應定期追蹤肝功能指數及病毒量以了解治療的狀況。目前四種口服抗病毒藥物發生抗藥性比例最低的藥物為貝樂克。因此選擇一種抗病毒效力強且發生抗藥性病毒比例低的口服抗B型肝炎病毒藥物是對病人最好的選擇。口服抗病毒藥物何時是最佳停藥時機並不一定，未來的治療期間應是朝向中、長期的治療發展。目前的共識是e抗原陽性的慢性B型肝炎患者血中e抗原轉為陰性之後，繼續服用6～12個月，可考慮停藥。血中e抗原陰性的慢性B型肝炎患者何時可以停藥則無一定標準。而口服抗病毒藥物的另一項缺點為停藥後有許多病人病毒會再復發。因此口服抗病毒藥物停藥後病人需密切追蹤。
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目前健保局有條件的給付口服抗病毒藥和干擾素來治療B型肝炎，詳細情形應詢問專科醫師。
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