Page 31 - 林口醫研部2022年12月電子報
P. 31
實驗採用2週與4週大的成長中健康小鼠腎臟進行snRNA-seq實驗,以
進一步了解腎臟上皮細胞的分化和再生過程。實驗使用兩週及四週大公
母老鼠各兩隻,共八隻小鼠。基因定序結果共獲得41784個細胞進行分析
,平均每個細胞偵測到的基因數目為2233。實驗主要結論如下:(1)本次
實驗的細胞分型與先前成年老鼠實驗相近,表示前次實驗結果的重復性
,且幼鼠和成年鼠腎臟細胞擁有相同的標誌基因。(2)二週大與四週大的
小鼠中,有發現近曲小管、遠曲小管、內皮細胞及纖維母細胞等不同型
態細胞的增殖細胞(proliferative cells)。且增殖細胞的比例在二週大的老鼠
明顯較高。(3)在初始分群時來源為不同性別的細胞,在分群上並無顯著
差異。細胞週期分析也可明顯看出增殖細胞的狀態。
隨後我將近曲小管細胞獨立出來重新分群 (re-cluster),重新分群後細
胞分群並沒有顯著改變,同樣的細胞依然被分在同一群。不同性別的基
因表現在二週大的小鼠上差異並不明顯,但在四週大的小鼠,可看到來
源分別為公鼠及母鼠的細胞被分在UMAP的兩側,意味著公鼠母鼠近曲小
管的基因表現在四週大的小鼠上有明顯差異。同時我也嘗試將纖維母細
胞進行重新分群,結果並未呈現性別差異。顯示這樣的性別差異沒有呈
現在所有種類的細胞上,此部分值得進一步探討。
Department of Medical Research & Development , Linkou Newsletter 31