Page 25 - 林口醫研部2022年12月電子報
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細胞核RNA的品質是研究能否成功的關鍵。在進行正式動物實驗之前
,我利用 Bioanalyzer來確認萃取出的細胞核RNA品質,並調整小鼠腎臟細
胞核萃取的流程。在經歷數次試驗後,確認homogenization為影響細胞核
RNA品質的關鍵步驟,並在調整細胞核萃取流程後,確認能取得品質較高
的細胞核RNA。
▲圖 : 分 析 細 胞 核 萃 取 流 程 中 各 個 步 驟 的 細 胞 核 RNA品 質 ,藉 此 確 認
homogenization (step 2)為影響細胞核RNA品質的關鍵步驟。並在
調整細胞核萃取流程後,確認能取得品質較高的細胞核RNA
(B)利用馬兜鈴酸誘發腎臟纖維化的小鼠模型進行snRNA-seq實驗
在確認能從小鼠腎臟取得高品質細胞核RNA之後,我利用馬兜鈴酸誘
發腎臟纖維化的小鼠模型進行snRNA-seq實驗。老鼠被隨機分配至實驗組
(chronic AAN) 與對照組 (naive control),動物實驗順利誘發腎臟纖維化及
肌酸酐上升。在進行RNA定序之後,我透過R軟體進行生物醫學分析。
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