Page 24 - 林口醫研部2022年12月電子報

腎 臟 科 呂 悅 安 醫 師

研究計畫主題

探討腎臟衰竭過程中腎臟近曲小管上皮細胞的RNA變化及調控

研究項目與實驗成果

(A)優化自小鼠腎臟取得高品質細胞核 RNA並 進 行 single-nucleus RNA

sequencing (snRNA-seq)的實驗步驟及流程

近 二 十 年 來 隨 著 next generation sequencing 技 術 的 發 展 ， RNA

sequencing被廣泛運用在生物醫學研究中，用以比較組織樣本基因表現。

我開始進修時，適逢實驗室要發展single-cell RNA sequencing (sc-RNA-seq)

的技術，而此技術非常適合用來研究單一細胞間的RNA表現差異，因此在

和指導教授討論後，決定以sc-RNA-seq作為論文的主要研究技術。

ScRNA-seq可針對個別細胞做基因序列的分析，然而要將single-cell技

術運用在腎臟上皮細胞的研究上卻遭遇限制。由於病變的上皮細胞較其

他細胞脆弱，容易在製備single-cell懸浮液的過程中死亡，因此會造成實

驗的選擇性偏差。並且由於近曲小管富含粒線體，容易在細胞分離的過

程中，因為細胞缺氧而產生發炎訊號。根據研究發表，在single-cell的實

驗中腎臟細胞核RNA的表現可以取代全細胞RNA表現，來探討腎臟損傷過

程中近曲小管上皮細胞的RNA變化與調控。因此在整個計畫中，我決定使

用snRNA-seq取代scRNA-seq來進行研究。

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