一、核酸定序
- 顧客定序送件需檢附哪些文件資料?
- 核酸定序申請單(MRD-SOP-SC-001-F02) (請隨表附上DNA template電泳圖和濃度，並註明loading的體積與Marker的濃度) 。
- 試驗委託單(MRD-POC-003-F01)一式3份。
- 如果顧客無法提供完整的定序所需資料但仍同意進行定序試驗，則視同顧客認同檢體符合定序之要求，並願意無條件接受試驗之結果。
- 顧客送件時的定序檢體所需濃度與體積?
| DNA種類 |
DNA濃度
(ng/μl) |
DNA體積
(μl) |
| PCR DNA（< 1000 bp） |
> 20 |
> 10 |
| PCR DNA（> 1000 bp） |
> 40 |
> 10 |
| Plasmid DNA |
> 200 |
> 10 |
- 顧客送件定序時所需檢附的引子(Primer)及其濃度和體積?
- 每個反應的primer至少提供濃度5 µM；體積2 µl。
- 1K以內的檢體需有forward和reverse兩端之primer；大於1K以上的檢體以500 bp為單位，每超過500 bp大小之檢體則需增加1個primer。
二、即時定量PCR(Q-PCR)
預約時間應於三日前預約登記或取消使用時段。
請使用原廠封膜及孔盤，並禁止在孔盤及封膜上標示任何標記。
三、Affymetrix 微陣列晶片
Affymetrix Genome-Wide Human SNP Array 6.0
DNA濃度50ng/ul以上，體積30ul。
OD 260/280 : 1.8-2.0，OD 260/230>1.0。
送件請附DNA檢體電泳圖。
Affymetrix GeneChip Human Genome U133 Plus 2.0
RNA 濃度600ng/ul以上，體積20ul。
RIN值大於7。
送件請附晶片型生物分析儀圖。
Affymetrix Clariom D assays, Human
RNA 濃度170ng/ul以上，體積20ul。
RIN值大於7。
送件請附晶片型生物分析儀圖。
Affymetrix Transcriptiome Array | Gene Array (Human, Mouse, Rat)
RNA 濃度170ng/ul以上，體積20ul。
RIN值大於7。
送件請附晶片型生物分析儀圖。
Affymetrix Gene Chip miRNA 4.0 Array
RNA 濃度130ng/ul以上，體積20ul。
RIN值大於7，OD260/280大於1.95。
送件請附晶片型生物分析儀圖。
Affymetrix Genome Wide CytoScan (750K, HD)
DNA濃度50-100ng/ul以上，體積30ul。
OD 260/280 : 1.8-2.0，OD 260/230>1.0。
送件請附DNA檢體電泳圖。
Affymetrix Genome Wide OncoScan
DNA濃度100ng/ul以上(NanoDrop)，體積20ul。
DNA濃度20ng/ul以上(Qubit)，體積20ul。
四、晶片型生物分析儀 (Agilent 2100 Bioanalyzer)
RNA 濃度需在50ng/ul以上，體積4ul。
五、次世代定序儀
- DNA(Mammalian, Mouse, Human, Rat, Plant)至少30 µL， 2.5 ng/µL以上。
- DNA(Bacteria)至少10 µL，1ng/µL以上。
- Exome Sequencing(Human)至少50 µL，4ng/µL以上。
- RNA(total RNA， species with polyA tails )至少10 µL，3 µg/µL以上。
- Metagenomic sequencing 每個樣品至少10 µL，Microbial GenomicDNA5ng /µL以上。
- Small RNA：1 µg total RNA or 10-50 ng purified small RNA, RIN ≥ 8。
- 以上檢體或library請於純水中保存，避免離子干擾實驗結果。
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