本科於1986 年1 月1 日成立，成立初期僅由北院區南下之一位主治醫師及一位住院醫師，病床由當初外科系共用病床，1986 年7 月1 日由兩位主治醫師參與工作，病房固定在十樓並開放10C及10D 為神經科病房，ICU 並於後來成立專屬之NSICU-1 & NSICU-2，1988 年由三位主治醫師加入工作，成立南部地區首先成立之腦神經外科訓練中心，招收專科主治醫師，並次第添購各項設備，目前各次專科均已建立，成為一多功能之腦神經外科醫療及教育訓練中心。