兒童常見的腹痛原因，以胃腸炎、便秘及功能性腸蠕動不正常等較常見。急性胃腸炎以嘔吐、腹瀉或合併發燒為主，需注意是否合併脫水引起精神不佳者而需接受點滴注射。另外如果大便帶有血絲或黏液便，則需考慮為細菌性腸炎，須把大便帶來化驗。 便秘可引起陣發性腹痛，常有解硬便、數天解一次或每次解便量不多甚至肛裂引起出血的現象。臨床可給予灌腸治療，若仍未見改善，則會安排腹部X光或超音波已進一步檢查。 比較要小心的是盲腸炎引起的腹痛，典型症狀有轉移性腹痛（先腹部上方或中央，後轉移到右下腹）、發燒、嘔吐、腹部僵硬等。但是年紀愈小，盲腸炎的表現愈不典型，往往到盲腸破掉引起腹膜炎才得到診斷。腸阻塞引起腹痛以腸套疊及腹股溝疝氣較常見，會有規律性的腹痛，較小的病童會以一陣一陣的哭鬧來表現。前者可合併嘔吐及解出草莓醬一般的血便，可用超音波作初步的檢查，經確認後再安排鋇劑灌腸治療，如果失敗，則需安排手術。後者以腹股溝腫塊來表現，可施以推回復位，如果無法以手推回，則需安排手術。 其他較少見的原因包括腹部腫瘤、肝膽疾病、消化性潰瘍、胰臟炎等其他胃腸系統疾病，或泌尿系統、生殖系統、肺炎、糖尿病等等都可引起腹痛而需進一步檢查及治療。