Page 15 - 醫研部6月份電子報
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基因序列分析
新興病毒變化多端且無法預測,可能經由基因突變或重組,或來自
野生動物,經由跨越宿主屏障進而感染到人類,繼而爆發疫情。近年來
快速發展的次世代定序NGS可在短時間內產生大量的DNA序列資料,提供
了分子生物學家探討基因體、轉錄因子和分子間交互作用等領域的有效
工具。
長庚團隊共成功完成30件病毒培養及全基因定序,已發表至GISAID
、GenBank。SARS-CoV-2全基因序列的組裝: 由許多長度為300 bp的reads
,組裝成完整的29 kb COVID-19 genome,目前定序的個案皆達到
99.2~100% coverage (如圖八)。
▲ 圖八、 SARS-CoV-2全基因序列
Department of Medical Research & Development, Linkou Newsletter 15