本院是雲嘉地區有能力提供小兒外科急重症24小時服務之少數後送責任醫院，由王世憲醫師(Wang Shih-Shan, M.D., Ph.D.)負責，目前本科對於新生兒及嬰幼兒之重大手術幾乎全面採用最先進的胸腹腔鏡執行，大大提昇了這些罹患先天性異常兒童術後的生活品質。我們也將傳統的腹股溝疝氣及包皮環切改良為無疤痕手術。本科積極從事醫學研究，目前題目包括(1)先天性橫膈膜疝氣致病機轉的探討(2)兒童腫瘤學之基礎研究(3)卡波西氏肉瘤病毒早期溶裂基因的轉錄調控分析。
婦女發生腹股溝疝氣比率遠不及男性病人的1/10，因此很容易被忽略，有報告指出高達5成女性並不知道自己得了疝氣而導致延誤就醫。特別是有懷孕、負重、便秘及咳嗽等這些因子的女性，更應特別注意疝氣發生。本院以新式單孔腹腔鏡內環縫合手術，治療女性疝氣，手術過程將組織的傷害降到最低，也同時做對側內環開口探查，術後更幾乎不留下任何疤痕。
目前每週二上午在G棟三樓婦兒醫療門診中心開設婦女疝氣特別門診。