大腸癌篩檢工具包括糞便潛血檢查、虛擬大腸鏡檢查、乙狀結腸鏡檢查、全大腸鏡檢查。一般來說乙狀結腸鏡檢查會忽略右側大腸病灶，延遲早期治療時機。全大腸鏡檢查才是預防大腸癌發生和早期發現大腸癌的最佳方法。其中糞便潛血檢查適用大量篩檢，衛生所都有提供，若糞便潛血檢查呈陽性，則轉介至醫院接受大腸鏡檢查。早期接受大腸鏡檢查，將可能有病變的息肉移除，可預防大腸癌發生。
大腸鏡適用在何種情況呢？
1. 糞便潛血陽性
2. 病患有下消化道不適之症狀，同時懷疑有結腸或直腸病灶
3. 病患本身有相關大腸直腸家族史或過去病史，需要做評估及追蹤
4. 年齡大於50歲之男性或女性非高危險群病患，均建議開始作大腸鏡或下消化道攝影之評估篩檢
5. 大腸鏡檢有異常發現或病患為大腸直腸癌患者均需規則追蹤
追蹤及篩檢
1. 一般風險之病患或家族中有非一等親之大腸直腸癌患者，於50歲後每年建議進行糞便潛血檢查及乙狀結腸鏡檢。
2. 家族中有一等親之大腸直腸癌患者於55歲後發病，其家屬於50 歲後每5年接受大腸鏡篩檢，家族中若有一等親之大腸直腸癌患者於55歲前發病，其家屬於40歲後應每5年接受大腸鏡篩檢。以上的篩檢追蹤如有異常發現則由臨床醫師再行密切追蹤。
3. 高風險族群例如家族性大腸息肉症(FAP)及遺傳非息肉性結腸直腸癌症(HNPCC)。
以家族性大腸息肉症(FAP)家族史而言，其大腸鏡追蹤篩檢之年齡應自青少年時期即開始，每年作大腸鏡追蹤。
以遺傳非息肉性結腸直腸癌症(HNPCC)家族史而言，其大腸鏡追蹤篩檢之年齡應自30歲開始，每1到2年作大腸鏡追蹤。