長庚紀念醫院高雄分院牙科之籌建係以台北林口醫學中心牙科十年之發展經驗為基礎，於民國73年起歷經三年之規劃及儲訓，遂於民國75年元旦開始牙科臨床醫療服務。牙科系歷經梁廣庫、漆承勇、盧心玉、歐陽玲、侯桂林、林瑩澤及現任吳友仁等主任的領導下日漸茁壯。發展二十年後，為了繼續為廣大的南部民眾提供更全方位的服務，牙科於民國96年11月起陸續搬遷至復健大樓三樓，佔地約600坪，全面更新60台設備新穎的治療椅，為南部第一家完整e化之牙科醫學中心。 本科的宗旨在促進國人口腔健康，提昇全民口腔衛生知識，建立科技、e化與人文關懷的牙科團隊醫療。二十一世紀是知識爆炸的時代，牙科系也配合本院推行新思維教育，讓未來的牙科醫療人員具備：以病人為中心的醫療，跨領域的團隊工作，基於實證的專業執行，醫療品質促進，以及資訊技術利用；並鼓勵醫師們從事醫學研究，以逐步完成本院『服務』、『教學』、『研究』之目的。