治療牙周病，必需先對牙周組織的狀況及破壞程度先作一番了解與評估，通常是藉由全口牙根尖X光片及牙周囊袋深度測量來達成，評估完後才能擬定治療計劃，通常牙周病的治療分三階段：

第一階段　牙周病基本治療: 

將口腔內所有的牙菌斑和牙結石盡量去除，包括病人本身口腔衛生清潔的完全配合: 牙刷及牙線或牙間刷等清潔工具的正確使用。而後以全口超音波洗牙或齒齦下刮除的方式，將牙周囊袋深部的結石刮除及牙根整平。
牙結石清除後有些人的牙齒會對冷熱產生敏感的現象，這是正常的反應，一般會在幾週內減緩、消失。

第二階段　牙周手術治療:

經過5-6週的基本治療及囗腔衛生教育，患者牙周組織發炎的情形受到適當的控制。但由於先前組織受損嚴重，有些患部病灶無法於基本治療之下，就能加以完全控制，此時便須藉由牙周手術的方式將藏在牙周囊袋深處的牙菌斑與牙結石完全清除，並將遭到破壞而呈不規則的齒槽骨缺陷整形，使牙周組織獲得好的癒合，回復健康。

資料來源:

1. Lindhe, J., Westfelt, E., Nyman, S. et al. (1982). Healing follow- ing surgical/non‐surgical
treatment of periodontal disease. Journal of Clinical Periodontology 9, 115–128.
2. Wennström, J.L., Tomasi, C., Bertelle, A., & Dellasega, E. (2005). Full‐mouth ultrasonic
debridement versus quadrant scaling and root planing as an initial approach in the treatment of
chronic periodontitis. Journal of Clinical Periodontology 32, 851–859.
3. Lindhe, J., Westfelt, E., Nyman, S., Socransky, S.S. & Haffajee, A.D. (1984). Long‐term effect of
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