紅斑性狼瘡（SLE）會吸附C3、C4，使的血清中的C3、C4濃度降低。在SLE的疾病中補體因子的濃度反映著病情。
C4的降低則出現於遺傳性遺傳性血管神經性水腫和冷球蛋白血症的疾病時。
補體因子屬於急性反應蛋白因此在發炎反應時血清中濃度會升高。
報告顯示補體因子的缺乏情況是有遺傳性的。