紅斑性狼瘡（SLE）會吸附C3、C4，使的血清中的C3、C4濃度降低。在SLE的疾病中補體因子的濃度反映著病情。

C3值的降低會發生在急性腎絲球腎炎。

補體因子屬於急性反應蛋白因此在發炎反應時血清中濃度會升高。

報告顯示補體因子的缺乏情況是有遺傳性的。