由於台灣B型肝炎帶原者的盛行率，以致肝癌的好發。本科以良好的手術、評估及照護，提供病患完善的治療。 其中切肝手術有九成以上不需輸血。膽道結石，尤其是肝內結石為台灣常見地域性疾病，由於切肝技術的精進，目前對於單側的肝內結石，若病患狀況及肝功能許可，在首次手術即行患側肝葉切除，同時解決結石、膽道狹窄及遲發性膽道癌的可能。
　　對於無法進行肝切除者，則會同放射診斷科，嘗試漸進式 膽道擴張術及支撐法，將肝內結石清除率提高到八成五左右，提供另一種的治療方法。本科與肝膽胃腸科密切合作，積極從事胃癌的研究，並參照日本胃癌研究學會的方法，針對此類病患作根除性切除加上淋巴廓清術，成效良好，尤其是早期胃癌五年存活率可達百分之九十以上。
　　內分泌外科的基礎研究及臨床治療亦有長足進展。尤以次發性副甲狀腺增生之皮下移植更屬獨創一格。由於社會形態的西化，乳癌病患也有逐年增加的趨勢，過去除對乳癌診斷及手術的態度積極外，更對乳癌細胞作更深一層的基礎性研究。