嚴重輸卵管疾病
如雙側輸卵管阻塞，積水。
在正常的情況下，卵巢排卵出來以後，輸卵管就像一個捕手，必須去接住卵巢排出來的這顆卵。精子就從陰道游到子宮頸，然後到了子宮腔，然後順著子宮腔流到輸卵管，輸卵管就是精子和卵子結合的地方，精子跟卵子在輸卵管裡面授精，變成授精卵以後，這個胚胎才會慢慢的回到子宮，在子宮著床。如果它的前端或末端塞住了，讓卵子沒辦法進到輸卵管，或者讓精子根本沒有機會游到輸卵管裡，這樣精子跟卵子在正常的情況下沒有辦法碰在一起，就必須靠試管嬰兒的技術，就是把精子跟卵子取到外面來，在試管裡讓它們去授精再殖入子宮。一般而言，輸卵管阻塞常是骨盆腔發炎或子宮內膜異位症所造成。在過去輸卵管手術再接通是一項選擇。不過在沾黏嚴重或輸卵管已有水腫的情況下，手術效果不佳，合併子宮外孕的機會大，所以做試管嬰兒是比較好的選擇。
子宮內膜異位症
子宮內膜異位症造成不孕的原因，除了輸卵管沾黏阻塞外，還包括骨盆腔環境對精子、卵子及胚胎的傷害，和子宮內環境異常對胚胎著床的不良影響。一般的治療包括手術療法、荷爾蒙療法。若患者在接受手術治療後六個月，或追加藥物療法後六個月，都無法自然懷孕，可以考慮人工生殖來得到比較好的懷孕率。
免疫性不孕症
男方精液或女方子頸黏液存在抗精蟲抗體者。
抗精蟲抗體會造成自然同房後精子無法順利通過子宮頸進入到子宮腔及輸卵管，而無法完成正常的精卵體內授精過程，它可經由精子體外純化術後作子宮腔內注入來改善。
男性不孕症
如精子活動力差，精子數目過少，精子形態異常。
精蟲的品質可經由精液洗滌改善。假如洗滌後精蟲回收，每㏄活動精蟲濃度可達二仟萬，則可先嘗試人工授精治療。如果經洗滌後活動精蟲仍不足，雖然女方的輸卵管通暢,精子也無法到達輸卵管，就應該考慮人工生殖治療，甚至需要做卵胞質內精蟲注入術了。
不明原因的不孕症
經醫師檢查男女雙方都沒有明顯不孕的原因，接受傳統型治療仍無法在一年內自然懷孕時，或連續進行多次（三至六次）治療仍告失敗者，可以考慮以人工生殖加強懷孕機率以及縮短等待時間。
有遺傳性疾病需要做著床前診斷者
其它
如慢性不排卵、骨盆腔粘連、卵巢衰竭需要接受他人之卵子捐贈者、不孕症夫妻無法有自然同房的性行為，譬如有脊椎損傷等。 |
